Oomycota

Les Oomycètes (division des Oomycota) comprennent entre 800 et 1 000 espèces (Kirk et al., 2001) d'organismes eucaryotes unicellulaires ou pluricellulaires Hétérocontes^, non photosynthétiques, également connus sous les noms de Pseudofungi ou d'Heterokontimycotina. Bien que de nombreux traits biochimiques, ultrastructuraux et génétiques les placent clairement dans les Hétérocontes, leur type de croissance comprenant des hyphes et leur mode de nutrition par osmotrophie ressemblent à ceux des champignons vrais du groupe des Fungi. Cependant, ils n'y sont pas étroitement apparentés.

Le terme oomycètes a été formé à partir du grec ᾠόν / ōión, « œuf », et μύκης / mukēs, « champignon ».

Appareil végétatif

L'appareil végétatif est de type fongique car il est généralement constitué de filaments non cloisonnés (ou siphons), toutefois des cloisons (septa) peuvent être présentes à la base de structures reproductives ou dans des compartiments anciens. Le cytoplasme contient des noyaux diploïdes, des mitochondries, les empilements de Golgi et des vacuoles.

Les parois sont généralement constituées de cellulose et dépourvues de chitine (sauf rares exceptions avec une paroi mixte) ce qui les différencie des « vrais champignons » Eumycètes dont les parois contiennent de la chitine et les rapproche de certaines algues et des plantes. ^{[réf. souhaitée]}

Appareil reproducteur

Écologie

Les Oomycètes sont communs dans l'eau, sur les déchets organiques et les cadavres des petits animaux. Certaines espèces vivent dans le sol en saprophytes sur les débris organiques. Plusieurs espèces sont des pathogènes majeurs de plantes, certaines espèces parasitent des animaux. La plupart des espèces de Saprolegnia sont des organismes saprophytes mais certaines espèces parasitent les poissons. Le genre Pythium comprend de nombreuses espèces parasites de plantes et quelques autres parasites d'animaux. Le genre Phytophthora est également responsable de maladies chez les végétaux sauvages et cultivés. Phytophthora infestans l'agent du mildiou de la pomme de terre est à l'origine de la grande famine en Irlande des années 1845-1851 qui fit peut-être un million de victimes. Plasmopara viticola est l'agent du mildiou de la vigne. Il est endémique en Amérique du Nord où il n'est pas très destructeur sur les vignes locales (Vitis rotundifolia est résistante). Il fut introduit en France en 1878 et eut des conséquences désastreuses pour la vigne européenne (Vitis vinifera cultivée) qui n'ayant jamais été exposée à ce pathogène était très sensible. La découverte par Millardet de la bouillie bordelaise, mélange de chaux et de sulfate de cuivre, représente le premier fongicide efficace trouvé contre ce genre de maladie.

Systématique

Oomycota Arx, 1967 a pour synonymes :

Hyphochytriomycota
Oomycetes
Peronosporomycotina
Pseudofungi^,^,^,

Ils étaient autrefois classés dans les Mastigomycotina (maintenant Chytridiomycota, depuis la séparation des Mastigomycota), parmi les Mycota, avec lesquels ils partagent un certain nombre de caractères (cellules filamenteuses : hyphes, absence de chlorophylle, nutrition sur de la matière organique...) ; mais ils présentent également de profondes divergences avec les mycètes (paroi cellulosique, noyaux diploïdes). Ils sont maintenant classés parmi les Chromista du fait de la présence de zoospores biflagellées et de l'utilisation de laminarine comme substance de réserve.

Dans les années 1980, Thomas Cavalier-Smith reconnait que les principales lignées de champignons-algues, autrement nommées Phycomycètes, ne doivent plus être considérées comme des champignons, et il crée le groupe des Pseudofungi pour les différencier. Il classe ces organismes dans un nouveau règne, les Chromistes, qui rassemble également les Diatomées et les Algues brunes^,

Position phylogénétique:

Eukaryota
- Bicontes
  - Chromoalvéolés
    - Straménopiles
      - Sloomycetes
        Oomycota
      - Ochrophyta

Taxon frère : Hyphochytriales

Les Pseudofungi descendraient d'algues chromistes unicellulaires hétérokontes qui auraient perdu leurs plastes permettant d'effectuer la photosynthèse, l'existence de plastes endosymbiotiques d'algues rouges ayant été démontrée. De là, un proto-pseudochampignon unicellulaire hétérotrophe, probablement un parasite de champignon, aurait obtenu ses gènes fongiques par transfert horizontal de gènes, ce qui aurait conduit au développement d'une multicellularité fongique convergente, expliquant pourquoi la paroi cellulaire des pseudochampignons est parfois constituée à la fois de chitine et de cellulose.

Liste des classes

La division des Oomycota regroupe les trois classes suivantes^,^,^,^, :

Bigyromonadea Caval.-Sm., 1998
Hyphochytrea Cavalier-Sm., 1986
Peronosporea

Selon MycoBank (3 décembre 2023) :

Oomycetes G. Winter, 1880
Peronosporomycetes Locq., 1974
Saprolegniomycetes Thines & Beakes, 2015

Notes et références

Notes

(en) Cet article est partiellement ou en totalité issu de l’article de Wikipédia en anglais intitulé « Pseudofungi » (voir la liste des auteurs).

Références

Voir aussi

Bibliographie

Alexopoulos, C. J., Mims, C. W., & Blackwell, M. (1996). Phylum Oomycota. Introductory mycology, 4, 683-737.
Dick, M. W. (1990). Phylum oomycota. Handbook of Protoctista, 661-685.
Helbert, W., Sugiyama, J., Ishihara, M., & Yamanaka, S. (1997). Characterization of native crystalline cellulose in the cell walls of Oomycota. Journal of Biotechnology, 57(1), 29-37 (http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0168165697000849 résumé).
Krings, M., Taylor, T. N., & Dotzler, N. (2011). The fossil record of the Peronosporomycetes (Oomycota). Mycologia, 103(3), 445-457.
MacDonald, E., Millward, L., Ravishankar, J. P., & Money, N. P. (2002). Biomechanical interaction between hyphae of two Pythium species (Oomycota) and host tissues. Fungal Genetics and Biology, 37(3), 245-249 (http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1087184502005145 résumé).
Rossman, A. Y., & Palm, M. E. (2006). Why are phytophthora and other oomycota not true fungi?. Outlooks on Pest Management, 17(5), 217.
Schimek, C., & Wöstemeyer, J. (2006). Pheromone action in the fungal groups Chytridiomycota, and Zygomycota, and in the Oomycota. In Growth, differentiation and sexuality (pp. 215-231). Springer Berlin Heidelberg (résumé).
Schröder, S., Telle, S., Nick, P., & Thines, M. (2011). Cryptic diversity of Plasmopara viticola (Oomycota, Peronosporaceae) in North America. Organisms Diversity & Evolution, 11(1), 3-7.

Liens externes

(en) Introduction to the Oomycota : site sur les oomycètes

Division des Oomycota

(en) AlgaeBase : embranchement Oomycota Arx ( classification) (consulté le 3 décembre 2023)
(en) Catalogue of Life : Oomycota (consulté le 3 décembre 2023)
(en) Index Fungorum : Oomycota Arx (consulté le 3 décembre 2023)
(fr en) GBIF : Oomycota (consulté le 3 décembre 2023)
(fr) INPN : Oomycota Arx, 1967 (TAXREF) (consulté le 3 décembre 2023)
(en) IRMNG : Oomycota (consulté le 3 décembre 2023) (non valide)
(en) MycoBank : Oomycota Arx (consulté le 3 décembre 2023)
(en) NCBI : Oomycota (taxons inclus) (consulté le 3 décembre 2023)
(en) OEPP : Oomycota (consulté le 3 décembre 2023)
(en) Paleobiology Database : Oomycota (consulté le 3 décembre 2023)
(en) Taxonomicon : Oomycota Arx (1967) (consulté le 3 décembre 2023)
(en) WoRMS : Oomycota ( liste espèces) (consulté le 3 décembre 2023)